Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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