Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cops9Q3U898 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms