Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Q3U6N9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Q3U6N9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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