Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Q3U595 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U595 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms