Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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