Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kdm4dQ3U2K5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kdm4dQ3U2K5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kdm4dQ3U2K5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Kdm4dQ3U2K5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Kdm4dQ3U2K5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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