Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem35bQ3U0Y2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms