Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms