Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy4Q3TYX8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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