Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21440Q3TTD8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21440Q3TTD8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms