Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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