Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trappc13Q3TIR1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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