Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms