Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RubcnlQ3TD16 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms