Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms