Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shroom4Q1W617 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms