Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms