Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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