Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms