Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem52bQ0VBF2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem52bQ0VBF2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem52bQ0VBF2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem52bQ0VBF2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem52bQ0VBF2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem52bQ0VBF2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem52bQ0VBF2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms