Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Neurl1bQ0MW30 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neurl1bQ0MW30 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms