Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms