Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms