Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnnm1Q0GA42 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnnm1Q0GA42 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms