Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc7a1Q09143 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc7a1Q09143 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms