Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdx4Q07424 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms