Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms