Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms