Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms