Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fgfr4Q03142 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms