Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms