Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GscQ02591 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GscQ02591 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GscQ02591 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GscQ02591 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GscQ02591 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GscQ02591 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GscQ02591 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms