Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snai1Q02085 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms