Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme2Q01768 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme2Q01768 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme2Q01768 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme2Q01768 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme2Q01768 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme2Q01768 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme2Q01768 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme2Q01768 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms