Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SelpQ01102 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelpQ01102 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelpQ01102 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SelpQ01102 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms