Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms