Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col8a1Q00780 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms