Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itga4Q00651 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms