Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms