Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms