Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mesp1P97309 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Mesp1P97309 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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