Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprvP70289 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PtprvP70289 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprvP70289 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PtprvP70289 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PtprvP70289 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PtprvP70289 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PtprvP70289 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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PtprvP70289 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprvP70289 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms