Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcbP68404 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms