Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csrnp1P59054 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csrnp1P59054 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csrnp1P59054 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csrnp1P59054 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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