Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms