Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Bace1P56818 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms