Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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