Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms