Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa6P50704 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms