Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
FmodP50608 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
FmodP50608 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms